MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes L312

Total Repeats: 8174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018642	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018642	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018642	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018642	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018642	G	7	7	307	313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018642	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018642	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018642	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018642	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018642	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018642	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018642	T	8	8	4504	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018642	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018642	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_018642	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018642	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018642	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018642	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018642	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018642	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018642	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018642	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018642	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018642	T	6	6	10643	10648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018642	AGT	2	6	13929	13934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018642	AAC	2	6	13967	13972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018642	AAT	2	6	14016	14021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018642	GAA	2	6	14070	14075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018642	AGCAAA	2	12	14087	14098	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018642	GCTT	2	8	14135	14142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018642	GCT	2	6	14187	14192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018642	AT	3	6	14213	14218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018642	CAA	2	6	14336	14341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018642	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018642	CTG	3	9	14461	14469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018642	GAA	2	6	14481	14486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018642	TCA	2	6	14515	14520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018642	ATGC	2	8	14556	14563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018642	AAT	2	6	14618	14623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018642	TGAAAA	2	12	14711	14722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018642	AT	3	6	15879	15884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018642	AAC	2	6	15896	15901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018642	GTT	2	6	15914	15919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018642	TAT	2	6	15977	15982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018642	T	6	6	15984	15989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018642	ATT	2	6	15996	16001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018642	CCA	2	6	16051	16056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018642	ATA	2	6	16060	16065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018642	ATA	2	6	16076	16081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018642	ATA	2	6	16093	16098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018642	TAT	2	6	16122	16127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018642	ATC	2	6	16841	16846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018642	TCA	2	6	16857	16862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018642	TTG	2	6	16874	16879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018642	AAT	2	6	16882	16887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018642	TAT	2	6	17878	17883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018642	ATT	2	6	17926	17931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018642	T	6	6	17930	17935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018642	A	6	6	17942	17947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018642	T	6	6	17992	17997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018642	AT	3	6	18056	18061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018642	A	6	6	18145	18150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018642	T	7	7	18160	18166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018642	T	6	6	18190	18195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018642	CTT	2	6	18220	18225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018642	G	6	6	19410	19415	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018642	CTC	2	6	23513	23518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018642	T	8	8	23581	23588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018642	A	6	6	23643	23648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018642	ATT	2	6	23655	23660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018642	GAG	2	6	23717	23722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018642	TCA	2	6	25187	25192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018642	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018642	TTA	2	6	26154	26159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018642	A	6	6	26202	26207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018642	CG	3	6	26246	26251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018642	AAG	2	6	27926	27931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018642	GGA	2	6	29561	29566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018642	ATT	2	6	30304	30309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018642	T	6	6	30317	30322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018642	GGA	2	6	30323	30328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018642	AAAT	2	8	30985	30992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018642	A	8	8	31000	31007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018642	AT	3	6	31032	31037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018642	TCA	2	6	31043	31048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018642	A	6	6	31149	31154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018642	AGGA	2	8	31163	31170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018642	GTC	2	6	31172	31177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018642	TAA	2	6	33093	33098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018642	T	8	8	35403	35410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018642	TCC	2	6	35438	35443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018642	T	6	6	36185	36190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018642	TA	3	6	36329	36334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018642	CAAT	2	8	36350	36357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018642	AGT	2	6	36412	36417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018642	AT	3	6	36424	36429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018642	GAAAA	2	10	36436	36445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018642	TAAA	2	8	36454	36461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018642	AAG	2	6	36476	36481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018642	A	8	8	36483	36490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018642	TTA	2	6	36523	36528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018642	T	7	7	36637	36643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018642	CAA	2	6	36656	36661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018642	T	7	7	36669	36675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018642	TAG	2	6	36681	36686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018642	AGATA	2	10	36692	36701	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018642	TTGA	2	8	36730	36737	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018642	TG	3	6	36814	36819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018642	A	6	6	36824	36829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018642	A	7	7	36833	36839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018642	A	6	6	36851	36856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018642	AGA	2	6	36859	36864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018642	AAAGG	2	10	37663	37672	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018642	CTATT	2	10	38159	38168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018642	T	6	6	38221	38226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018642	T	6	6	38321	38326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018642	A	6	6	38359	38364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018642	A	7	7	38719	38725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018642	T	7	7	38744	38750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018642	CCTT	2	8	39567	39574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018642	ATA	2	6	40728	40733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018642	CAA	2	6	40787	40792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018642	TCT	2	6	46702	46707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018642	A	7	7	46772	46778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018642	ATG	2	6	46812	46817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018642	AAAT	2	8	46865	46872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018642	AGG	2	6	47927	47932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018642	AGA	2	6	47933	47938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018642	C	6	6	47958	47963	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_018642	AGG	2	6	51493	51498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018642	ATAA	2	8	53427	53434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018642	GACTT	2	10	53456	53465	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018642	A	7	7	53490	53496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018642	AGTG	2	8	53505	53512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018642	T	7	7	54186	54192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018642	TC	3	6	54206	54211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018642	TTAG	2	8	54238	54245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018642	TGA	2	6	54253	54258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018642	GTTA	2	8	55603	55610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018642	ATA	2	6	55621	55626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018642	ATT	2	6	55648	55653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018642	GCTC	2	8	55658	55665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018642	ATGGT	2	10	55708	55717	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018642	AGG	2	6	55750	55755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018642	ATTC	2	8	56062	56069	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018642	GAG	2	6	56098	56103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018642	AGG	2	6	56681	56686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018642	T	6	6	56971	56976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018642	AAG	2	6	57014	57019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018642	TATT	2	8	57031	57038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018642	TA	3	6	57050	57055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_018642	T	6	6	116032	116037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_018642	AT	3	6	119577	119582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_018642	TA	3	6	119649	119654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_018642	GAG	2	6	119683	119688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
295	NC_018642	AG	3	6	120547	120552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
296	NC_018642	AAT	2	6	121683	121688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_018642	T	6	6	143602	143607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_018642	A	6	6	143636	143641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_018642	T	7	7	196137	196143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_018642	CTA	2	6	196155	196160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
440	NC_018642	TTGTC	2	10	196163	196172	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
441	NC_018642	A	6	6	196227	196232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_018642	AATAAA	2	12	196238	196249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_018642	AT	3	6	196347	196352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_018642	TA	4	8	196376	196383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_018642	ATT	2	6	196393	196398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_018642	ATG	2	6	196455	196460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
447	NC_018642	ATG	2	6	196509	196514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_018642	ATT	2	6	196518	196523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_018642	ACAAA	2	10	196528	196537	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
450	NC_018642	TAG	2	6	196541	196546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_018642	A	11	11	196575	196585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_018642	T	8	8	196587	196594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_018642	T	8	8	196626	196633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_018642	ATT	2	6	196634	196639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_018642	GAA	2	6	196651	196656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_018642	TTGC	2	8	196670	196677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
457	NC_018642	T	6	6	196691	196696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_018642	GT	3	6	196718	196723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_018642	GGT	2	6	196772	196777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
461	NC_018642	GTT	2	6	197116	197121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_018642	A	7	7	197577	197583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_018642	TCT	2	6	197600	197605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_018642	TAAT	2	8	197621	197628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_018642	GAG	2	6	197647	197652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
466	NC_018642	ATG	2	6	197661	197666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_018642	TTC	2	6	197717	197722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_018642	CAAA	2	8	197768	197775	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
471	NC_018642	A	7	7	197802	197808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_018642	T	6	6	197819	197824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_018642	A	6	6	197842	197847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_018642	TCAT	2	8	197864	197871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
475	NC_018642	TA	3	6	197901	197906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_018642	TAA	2	6	199306	199311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_018642	A	6	6	199310	199315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_018642	T	6	6	201075	201080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_018642	GAAA	2	8	201127	201134	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_018642	ATA	2	6	201145	201150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_018642	T	6	6	201151	201156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_018642	TAT	2	6	201170	201175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_018642	CATA	2	8	201203	201210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
487	NC_018642	ATTT	2	8	201222	201229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_018642	T	7	7	201294	201300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_018642	AAT	2	6	201306	201311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_018642	AT	3	6	201310	201315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_018642	CCT	2	6	202279	202284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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500	NC_018642	ATT	2	6	204184	204189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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